Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZV7

HAPLN2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN2Q9GZV7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HAPLN2Q9GZV7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HAPLN2Q9GZV7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HAPLN2Q9GZV7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HAPLN2Q9GZV7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HAPLN2Q9GZV7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HAPLN2Q9GZV7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HAPLN2Q9GZV7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HAPLN2Q9GZV7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HAPLN2Q9GZV7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HAPLN2Q9GZV7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HAPLN2Q9GZV7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HAPLN2Q9GZV7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HAPLN2Q9GZV7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HAPLN2Q9GZV7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HAPLN2Q9GZV7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HAPLN2Q9GZV7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HAPLN2Q9GZV7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HAPLN2Q9GZV7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HAPLN2Q9GZV7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms