Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REXO4Q9GZR2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
REXO4Q9GZR2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms