Protein–RNA interactions for Protein: Q9C004

SPRY4, Protein sprouty homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY4Q9C004 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPRY4Q9C004 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRY4Q9C004 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms