Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM8Q9BZR9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms