Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPO3Q9BXY4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RSPO3Q9BXY4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms