Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM62Q9BVG3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM62Q9BVG3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM62Q9BVG3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms