Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3CQ9BUI4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3CQ9BUI4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3CQ9BUI4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms