Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MKNK1Q9BUB5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKNK1Q9BUB5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKNK1Q9BUB5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms