Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDFIP1Q9BT67 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms