Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGPAT1Q99943 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGPAT1Q99943 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms