Protein–RNA interactions for Protein: Q99259

GAD1, Glutamate decarboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAD1Q99259 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAD1Q99259 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAD1Q99259 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAD1Q99259 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAD1Q99259 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAD1Q99259 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAD1Q99259 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GAD1Q99259 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAD1Q99259 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAD1Q99259 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAD1Q99259 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GAD1Q99259 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAD1Q99259 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAD1Q99259 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAD1Q99259 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAD1Q99259 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAD1Q99259 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAD1Q99259 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAD1Q99259 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAD1Q99259 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GAD1Q99259 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms