Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KC1Q96S38 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms