Protein–RNA interactions for Protein: Q96QG7

MTMR9, Myotubularin-related protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR9Q96QG7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR9Q96QG7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR9Q96QG7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR9Q96QG7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms