Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP5Q96PP8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP5Q96PP8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP5Q96PP8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP5Q96PP8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GBP5Q96PP8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP5Q96PP8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP5Q96PP8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP5Q96PP8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP5Q96PP8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP5Q96PP8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP5Q96PP8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP5Q96PP8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP5Q96PP8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP5Q96PP8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP5Q96PP8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP5Q96PP8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP5Q96PP8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP5Q96PP8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP5Q96PP8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP5Q96PP8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms