Protein–RNA interactions for Protein: Q96N06

SPATA33, Spermatogenesis-associated protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA33Q96N06 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPATA33Q96N06 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPATA33Q96N06 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms