Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC41A2Q96JW4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC41A2Q96JW4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC41A2Q96JW4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC41A2Q96JW4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC41A2Q96JW4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC41A2Q96JW4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC41A2Q96JW4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC41A2Q96JW4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC41A2Q96JW4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC41A2Q96JW4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC41A2Q96JW4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC41A2Q96JW4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC41A2Q96JW4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC41A2Q96JW4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC41A2Q96JW4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC41A2Q96JW4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC41A2Q96JW4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC41A2Q96JW4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC41A2Q96JW4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC41A2Q96JW4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms