Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms