Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYFIP2Q96F07 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms