Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 TACC3-206ENST00000470136 650 ntTSL 310.38□□□□□ -0.753e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ZDHHC14-206ENST00000517432 3646 ntTSL 210.38□□□□□ -0.755e-7■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SETBP1-201ENST00000282030 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.753e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RASGRF2-202ENST00000502677 2752 ntTSL 210.31□□□□□ -0.763e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 LRGUK-201ENST00000285928 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.773e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RAB27A-204ENST00000563262 702 ntTSL 310.26□□□□□ -0.773e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.773e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TRAPPC9-209ENST00000521167 545 ntTSL 410.18□□□□□ -0.783e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SCMH1-201ENST00000326197 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.793e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RBM26-201ENST00000267229 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.793e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 DDX6-201ENST00000525082 1232 ntTSL 210.13□□□□□ -0.793e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SARS-205ENST00000477544 694 ntTSL 210.13□□□□□ -0.793e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SYNE2-215ENST00000554997 711 ntTSL 210.11□□□□□ -0.793e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SLC20A2-210ENST00000522401 577 ntTSL 410.11□□□□□ -0.793e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ACVR1-210ENST00000539637 564 ntTSL 410.09□□□□□ -0.793e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TRAIP-202ENST00000469027 1145 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ATP7B-204ENST00000400370 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.82e-10■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TRAIP-205ENST00000475495 511 ntTSL 310□□□□□ -0.813e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 KDM2A-201ENST00000308783 3666 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.813e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 MLH1-201ENST00000231790 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.813e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 BDH1-213ENST00000477015 595 ntTSL 29.96□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SUOX-212ENST00000550478 613 ntTSL 39.96□□□□□ -0.823e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TRIO-214ENST00000509967 4949 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.826e-7■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.822e-10■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 UBAP2L-201ENST00000271877 3997 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.833e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 DDB1-206ENST00000535283 1220 ntTSL 29.88□□□□□ -0.833e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ZNF133-213ENST00000626025 616 ntTSL 59.87□□□□□ -0.833e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ATP7B-205ENST00000418097 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.832e-10■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ATP7B-211ENST00000634308 4321 ntTSL 1 (best)9.84□□□□□ -0.832e-10■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SCMH1-208ENST00000397171 3186 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.843e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RSRC2-214ENST00000527796 3156 ntTSL 59.79□□□□□ -0.843e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 FLJ37035-205ENST00000528844 718 ntTSL 29.78□□□□□ -0.843e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PARP14-202ENST00000474629 7915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.843e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 EXOC4-219ENST00000486013 1600 ntTSL 59.71□□□□□ -0.863e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 GRSF1-206ENST00000508091 419 ntTSL 39.66□□□□□ -0.863e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TMEM241-201ENST00000383233 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.873e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SCMH1-204ENST00000361705 3115 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.873e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 MLH1-221ENST00000536378 2567 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.873e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 EZH1-205ENST00000585893 2394 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.883e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 EZH1-217ENST00000590078 2392 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.883e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 AP000446.1-201ENST00000530045 2643 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.893e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 FAM133B-202ENST00000427372 931 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.893e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SYNE2-213ENST00000554805 3481 ntTSL 1 (best)9.48□□□□□ -0.893e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 AKAP13-217ENST00000560302 3765 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.93e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PARP14-203ENST00000474669 5229 ntTSL 1 (best)9.45□□□□□ -0.93e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ATP7B-215ENST00000634844 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.92e-10■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 GRSF1-203ENST00000502323 1794 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.93e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SCMH1-211ENST00000456518 1586 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.93e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 AP000446.1-202ENST00000534572 453 ntTSL 39.41□□□□□ -0.93e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 DNAJC3-201ENST00000376795 2273 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.93e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ZNF133-208ENST00000434018 523 ntTSL 39.35□□□□□ -0.913e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.923e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TMEM59-203ENST00000371341 1116 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.923e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SUOX-213ENST00000551698 598 ntTSL 49.29□□□□□ -0.923e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ACVR1-208ENST00000440523 534 ntTSL 39.2□□□□□ -0.943e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SCMH1-203ENST00000361191 2906 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.943e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 FAM193A-209ENST00000513898 4202 ntTSL 1 (best)9.18□□□□□ -0.943e-8■■■■■ 70.6
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TBRG4Q969Z0 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.963e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 EZH1-215ENST00000588897 2283 ntTSL 29.05□□□□□ -0.963e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 NUP50-AS1-203ENST00000609284 710 ntTSL 1 (best)9□□□□□ -0.973e-8■■■■■ 70.6
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TBRG4Q969Z0 FAM193A-203ENST00000502458 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.983e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 MLH1-220ENST00000492474 589 ntTSL 58.93□□□□□ -0.983e-8■■■■■ 70.6
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TBRG4Q969Z0 SYNE2-220ENST00000555612 6766 ntTSL 1 (best)8.89□□□□□ -0.993e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RTTN-216ENST00000640376 3307 ntTSL 58.88□□□□□ -0.993e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 COG2-201ENST00000366668 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.993e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 MLH1-216ENST00000458205 2608 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.993e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SCMH1-205ENST00000372595 3231 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -13e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 FAM193A-204ENST00000505311 4110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -13e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 CLTC-212ENST00000580081 575 ntTSL 48.76□□□□□ -1.013e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SYNE2-217ENST00000555022 3396 ntTSL 1 (best)8.75□□□□□ -1.013e-8■■■■■ 70.6
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TBRG4Q969Z0 FOCAD-207ENST00000603631 672 ntTSL 58.67□□□□□ -1.023e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 UBAP2L-208ENST00000433615 1789 ntTSL 1 (best)8.66□□□□□ -1.023e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 WDR20-212ENST00000557186 631 ntTSL 38.66□□□□□ -1.023e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PDCD4-201ENST00000280154 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.039e-7■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 LINC01572-202ENST00000563770 568 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.033e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RMDN1-214ENST00000521045 602 ntTSL 38.54□□□□□ -1.043e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.056e-7■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 EXOC4-205ENST00000462055 2364 ntTSL 1 (best)8.47□□□□□ -1.053e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SCMH1-210ENST00000402904 3204 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.063e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SAR1A-202ENST00000373238 3227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.063e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.079e-7■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 NARS2-202ENST00000525345 861 ntTSL 58.39□□□□□ -1.073e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.073e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.076e-7■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 CDKL5-209ENST00000635828 3823 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.083e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.083e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 EZH1-208ENST00000586103 2752 ntTSL 58.3□□□□□ -1.083e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ZBTB49-204ENST00000504302 523 ntTSL 1 (best)8.28□□□□□ -1.083e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SYNE2-205ENST00000394768 11095 ntTSL 1 (best)8.25□□□□□ -1.093e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ZNF133-202ENST00000360010 481 ntTSL 58.2□□□□□ -1.13e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 DDB1-208ENST00000537120 1215 ntTSL 28.18□□□□□ -1.13e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RMDN1-219ENST00000524172 810 ntTSL 58.13□□□□□ -1.113e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TNS4-201ENST00000254051 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.113e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 KDM2A-205ENST00000525041 697 ntTSL 48.11□□□□□ -1.113e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ELAVL1-204ENST00000596154 880 ntTSL 38.09□□□□□ -1.113e-8■■■■■ 70.6
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