Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EXT2Q93063 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXT2Q93063 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXT2Q93063 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXT2Q93063 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXT2Q93063 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXT2Q93063 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXT2Q93063 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EXT2Q93063 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXT2Q93063 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXT2Q93063 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms