Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D1Q8WV19 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D1Q8WV19 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms