Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP133Q8WUM0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NUP133Q8WUM0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP133Q8WUM0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP133Q8WUM0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP133Q8WUM0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP133Q8WUM0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP133Q8WUM0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP133Q8WUM0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP133Q8WUM0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP133Q8WUM0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP133Q8WUM0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP133Q8WUM0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP133Q8WUM0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms