Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFF2

SLC24A4, Sodium/potassium/calcium exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A4Q8NFF2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC24A4Q8NFF2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC24A4Q8NFF2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC24A4Q8NFF2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC24A4Q8NFF2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC24A4Q8NFF2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC24A4Q8NFF2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC24A4Q8NFF2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms