Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPCAT1Q8NF37 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms