Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBR7Q8N806 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR7Q8N806 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms