Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CA13Q8N1Q1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CA13Q8N1Q1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CA13Q8N1Q1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms