Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8AQ8IWT6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC8AQ8IWT6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC8AQ8IWT6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC8AQ8IWT6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC8AQ8IWT6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC8AQ8IWT6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms