Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP9Q7RTR0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms