Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY3Q7L099 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms