Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINGO4Q6UY18 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms