Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLC4A10Q6U841 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC4A10Q6U841 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms