Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEPROQ6NW34 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms