Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCARA3Q6AZY7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARA3Q6AZY7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms