Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LARP1BQ659C4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARP1BQ659C4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.1 ms