Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXT5

SYPL2, Synaptophysin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL2Q5VXT5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPL2Q5VXT5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPL2Q5VXT5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPL2Q5VXT5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPL2Q5VXT5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPL2Q5VXT5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPL2Q5VXT5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPL2Q5VXT5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYPL2Q5VXT5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYPL2Q5VXT5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms