Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD1Q5VV17 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms