Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF648Q5T619 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF648Q5T619 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms