Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIK3CD-AS1Q5SR53 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms