Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf48Q5BLP8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf48Q5BLP8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms