Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LACTB2Q53H82 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LACTB2Q53H82 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms