Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL22Q53GT1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms