Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
FHOD3Q2V2M9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FHOD3Q2V2M9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms