Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I3

FAM83E, Protein FAM83E, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83EQ2M2I3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM83EQ2M2I3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM83EQ2M2I3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms