Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC142Q17RM4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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