Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CARTPTQ16568 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARTPTQ16568 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms