Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA6Q16445 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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