Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFDHQ16134 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms