Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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