Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALX1Q15699 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALX1Q15699 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
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