Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SURF1Q15526 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SURF1Q15526 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SURF1Q15526 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
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